Un joven niño llamado Shinta es salvado por Hiko Seijuro y dado el nombre de Kenshin. Él entrena a Kenshin ver Rurouni Kenshin: Tsuiokuhen 1999 en el camino de Hiten Mitsurugi Ryuu, una técnica de espada sin rival. Como la guerra civil se intensifica, el joven Kenshin siente que su deber es ayudar a salvar personas. Lo que hace convertirse ver Rurouni Kenshin: Tsuiokuhen 1999 en el más temido Hitokiri Battousai.
